MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mesorhizobium loti MAFF303099 plasmid pMLa

Total Repeats: 5819

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_002679	AGC	2	6	35415	35420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488195
502	NC_002679	GCC	2	6	35486	35491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488195
503	NC_002679	AGAA	2	8	35598	35605	75 %	0 %	25 %	0 %	13488195
504	NC_002679	GTG	2	6	35757	35762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488195
505	NC_002679	CAA	2	6	35779	35784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13488195
506	NC_002679	GCT	2	6	35788	35793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488195
507	NC_002679	CGC	2	6	35796	35801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488195
508	NC_002679	TGAC	2	8	35814	35821	25 %	25 %	25 %	25 %	13488195
509	NC_002679	GTC	2	6	35849	35854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488195
510	NC_002679	TGG	2	6	35867	35872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488195
511	NC_002679	CAA	2	6	35929	35934	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13488195
512	NC_002679	CGC	2	6	35983	35988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488196
513	NC_002679	GGT	2	6	35992	35997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488196
514	NC_002679	TC	3	6	36026	36031	0 %	50 %	0 %	50 %	13488196
515	NC_002679	CGT	2	6	36037	36042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488196
516	NC_002679	ATC	2	6	36093	36098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488196
517	NC_002679	TTC	2	6	36117	36122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488196
518	NC_002679	GGA	2	6	36177	36182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13488196
519	NC_002679	TCG	2	6	36196	36201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488196
520	NC_002679	GCA	2	6	36213	36218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488196
521	NC_002679	GCT	2	6	36230	36235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488196
522	NC_002679	GGT	2	6	36257	36262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488196
523	NC_002679	GTC	2	6	36336	36341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488196
524	NC_002679	GCG	2	6	36385	36390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488196
525	NC_002679	TCC	2	6	36412	36417	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488196
526	NC_002679	GCC	2	6	36450	36455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488196
527	NC_002679	GTC	2	6	36499	36504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488196
528	NC_002679	CG	3	6	36510	36515	0 %	0 %	50 %	50 %	13488196
529	NC_002679	TGC	2	6	36541	36546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488196
530	NC_002679	ATCGG	2	10	36588	36597	20 %	20 %	40 %	20 %	13488196
531	NC_002679	GGT	2	6	36657	36662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488196
532	NC_002679	CT	3	6	36667	36672	0 %	50 %	0 %	50 %	13488196
533	NC_002679	TCA	3	9	36682	36690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488196
534	NC_002679	GGC	4	12	36728	36739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488196
535	NC_002679	CGG	3	9	36776	36784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488196
536	NC_002679	CAT	2	6	36812	36817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488196
537	NC_002679	ATG	2	6	36866	36871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488196
538	NC_002679	CAT	2	6	36898	36903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488197
539	NC_002679	GTT	2	6	36905	36910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13488197
540	NC_002679	GTC	2	6	36923	36928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488197
541	NC_002679	TCG	2	6	36936	36941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488197
542	NC_002679	CAC	2	6	37015	37020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488197
543	NC_002679	TCT	2	6	37083	37088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488197
544	NC_002679	TGC	2	6	37144	37149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488197
545	NC_002679	TTC	2	6	37151	37156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488197
546	NC_002679	TTC	2	6	37179	37184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488197
547	NC_002679	TAC	2	6	37196	37201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488197
548	NC_002679	TTC	2	6	37202	37207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488197
549	NC_002679	CGG	2	6	37270	37275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488197
550	NC_002679	CGG	2	6	37278	37283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488197
551	NC_002679	GCCC	2	8	37298	37305	0 %	0 %	25 %	75 %	13488197
552	NC_002679	TCCT	2	8	37311	37318	0 %	50 %	0 %	50 %	13488197
553	NC_002679	TCA	2	6	37325	37330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488197
554	NC_002679	GTC	2	6	37450	37455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488197
555	NC_002679	TGG	2	6	37528	37533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488197
556	NC_002679	CAT	2	6	37555	37560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488197
557	NC_002679	GT	3	6	37609	37614	0 %	50 %	50 %	0 %	13488197
558	NC_002679	TGG	2	6	37618	37623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488197
559	NC_002679	CAC	2	6	37624	37629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488197
560	NC_002679	GCT	2	6	37645	37650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488197
561	NC_002679	GAT	2	6	37711	37716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488197
562	NC_002679	CGC	2	6	37735	37740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488197
563	NC_002679	CAGC	2	8	37750	37757	25 %	0 %	25 %	50 %	13488197
564	NC_002679	CGG	2	6	37762	37767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488197
565	NC_002679	GAA	2	6	37868	37873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488198
566	NC_002679	CGA	3	9	37915	37923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488198
567	NC_002679	AGC	2	6	37999	38004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488198
568	NC_002679	CG	3	6	38012	38017	0 %	0 %	50 %	50 %	13488198
569	NC_002679	GCC	2	6	38100	38105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488198
570	NC_002679	TCAA	2	8	38161	38168	50 %	25 %	0 %	25 %	13488198
571	NC_002679	GCTG	2	8	38312	38319	0 %	25 %	50 %	25 %	13488198
572	NC_002679	CTG	2	6	38391	38396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488198
573	NC_002679	CATGA	2	10	38403	38412	40 %	20 %	20 %	20 %	13488198
574	NC_002679	AGA	2	6	38530	38535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488198
575	NC_002679	GGC	2	6	38578	38583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488199
576	NC_002679	GC	4	8	38586	38593	0 %	0 %	50 %	50 %	13488199
577	NC_002679	TGAGC	2	10	38598	38607	20 %	20 %	40 %	20 %	13488199
578	NC_002679	TGT	2	6	38637	38642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13488199
579	NC_002679	GCA	2	6	38645	38650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488199
580	NC_002679	GATA	2	8	38736	38743	50 %	25 %	25 %	0 %	13488199
581	NC_002679	ACG	2	6	38878	38883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488199
582	NC_002679	GGC	2	6	38953	38958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488199
583	NC_002679	AGC	2	6	38960	38965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488199
584	NC_002679	AGC	2	6	39056	39061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488199
585	NC_002679	ACT	2	6	39080	39085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488199
586	NC_002679	GCAGG	2	10	39171	39180	20 %	0 %	60 %	20 %	13488199
587	NC_002679	CTT	2	6	39401	39406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488200
588	NC_002679	CTTC	2	8	39415	39422	0 %	50 %	0 %	50 %	13488200
589	NC_002679	CAG	2	6	39450	39455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488200
590	NC_002679	GAT	2	6	39458	39463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488200
591	NC_002679	TGG	2	6	39601	39606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488200
592	NC_002679	AGA	2	6	39610	39615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488200
593	NC_002679	TCG	2	6	39655	39660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488200
594	NC_002679	TCG	2	6	39675	39680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488200
595	NC_002679	AGG	2	6	39727	39732	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13488200
596	NC_002679	CGA	2	6	40495	40500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488201
597	NC_002679	TGA	2	6	40562	40567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488201
598	NC_002679	CCA	2	6	40579	40584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488201
599	NC_002679	AGCA	2	8	40593	40600	50 %	0 %	25 %	25 %	13488201
600	NC_002679	TCCT	2	8	40648	40655	0 %	50 %	0 %	50 %	13488201
601	NC_002679	CAA	2	6	40658	40663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13488201
602	NC_002679	CAG	2	6	40738	40743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488201
603	NC_002679	CAA	2	6	40746	40751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13488201
604	NC_002679	TGC	2	6	40762	40767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488201
605	NC_002679	CG	3	6	40821	40826	0 %	0 %	50 %	50 %	13488201
606	NC_002679	GCA	2	6	40950	40955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488201
607	NC_002679	GC	3	6	41004	41009	0 %	0 %	50 %	50 %	13488201
608	NC_002679	GTC	2	6	41032	41037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488201
609	NC_002679	CGC	2	6	41132	41137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488201
610	NC_002679	AG	4	8	41157	41164	50 %	0 %	50 %	0 %	13488201
611	NC_002679	GCAA	2	8	41176	41183	50 %	0 %	25 %	25 %	13488201
612	NC_002679	TTG	2	6	41233	41238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13488201
613	NC_002679	CGG	2	6	41248	41253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488201
614	NC_002679	AGGA	2	8	41272	41279	50 %	0 %	50 %	0 %	13488201
615	NC_002679	CAA	2	6	41351	41356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13488201
616	NC_002679	GC	3	6	41361	41366	0 %	0 %	50 %	50 %	13488201
617	NC_002679	TGA	2	6	41380	41385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488201
618	NC_002679	GAGAG	2	10	41387	41396	40 %	0 %	60 %	0 %	13488201
619	NC_002679	TTC	2	6	41897	41902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488343
620	NC_002679	AGGC	2	8	41924	41931	25 %	0 %	50 %	25 %	13488343
621	NC_002679	CCG	2	6	41947	41952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488343
622	NC_002679	CGC	2	6	41978	41983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488343
623	NC_002679	TCG	2	6	42042	42047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488343
624	NC_002679	GCA	2	6	42134	42139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488344
625	NC_002679	ACA	2	6	42149	42154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13488344
626	NC_002679	CCT	2	6	42156	42161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488344
627	NC_002679	CCG	2	6	42209	42214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488344
628	NC_002679	CTGAC	2	10	42253	42262	20 %	20 %	20 %	40 %	13488344
629	NC_002679	T	9	9	43623	43631	0 %	100 %	0 %	0 %	13488058
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